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提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

天津女排第15次夺得联赛冠军 李盈莹当选MVP******

  中新社北京1月9日电 2022-2023中国女子排球超级联赛8日晚落下帷幕。随着天津队以3:0战胜上海队,天津女排在三场两胜制的决赛中以总比分2:0击败对手成功卫冕,队史第15次夺得联赛冠军,李盈莹当选MVP(最有价值球员)。

  天津女排是中国女子排坛一支劲旅,目前拥有李盈莹、王媛媛、姚迪等一众知名国手,还聘请了出生于古巴的强力接应瓦尔加斯加盟,展现出强劲的整体实力。

  本赛季联赛决赛赛制为三场两胜制,7日的决赛首回合对阵天津队以3:0胜出,但三局开局阶段天津队都落后于上海队,最终均逆转拿下。

  8日决赛第二回合较量,天津女排一改开局慢热的状态,上海队则处于被动,攻防两端漏洞频出,天津队攻势不减,以25:18先下一城。

  第二局上海队进行人员调整,但在天津队进攻端持续高压之下,仍难打开局面,多点开花的天津女排以25:12再胜一局。第三局背水一战的上海队一度将比分紧咬,但关键时刻天津队再度占据主动,逼迫对手连连失误,最终天津队以25:20获胜,大比分3:0战胜上海队,夺得了本赛季联赛冠军。

  本赛季天津女排在22场比赛中获得全胜,仅在第一阶段和第二阶段分别对阵北京队和山东队时各丢掉一局。天津女排第15次捧起联赛冠军奖杯,也是自2019-2020赛季以来实现联赛“四连冠”。

  在单项奖评选中,天津女排也成为最大赢家,将11个单项奖中的7个奖项收入囊中。分量最重的“最有价值球员”奖项归属李盈莹,她还同时当选“最具人气运动员”和“最佳主攻手”,瓦尔加斯为“最佳外援”,队长姚迪当选“最佳二传手”,王媛媛为“最佳副攻手”,主帅王宝泉当选“最佳教练”。

  李盈莹表示,本赛季承担的任务更重,技战术打法也有不小变化。回顾整个赛季的个人表现,李盈莹说,自己心态比以往更平稳,在球场上也更加成熟稳重。“场上我要扣一些比较困难的球,在队伍遇到困难的时候,也需要我更多地站出来,用实际行动带动大家,这是跟以往不一样的。”

  联赛结束后,在休息调整的同时,李盈莹表示,期待继续在发球、扣球等技术环节提升实力,未来为国家队作出更大贡献。(完)

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